KATALYZÁTOR SLD
SHD katalytická triádaako už názov napovedá, pozostáva z aminokyselín (AA) serínu, histidínu a aspartátu, ktorých jednopísmenové kódy sú S, H a D, v danom poradí.
Tento druh triády existuje napríklad v enzýme trypsín, ktorý sa nachádza v pankrease, sa najprv syntetizuje ako neaktívny prekurzor (takže nevykonáva svoju prácu, kým nie je potrebný).
ŠPECIFICKÉ PEPTIDOVÉ KARTY TRYPSIN CUTS
Myšlienka s trypsínom spočíva v tom, že má hydrolyzovať špecifické peptidové väzby, kde príslušná peptidová väzba nasleduje po špecifickom
Zvýraznená väzba je peptidová väzba, ktorá je hydrolyzovaná počas enzymatickej aktivity po zistení zvýraznenej väzby
AMINOVÉ KYSELINY
serine v tejto triáde by bolo skvelé nucleophile, ak nie pre protón. Po deprotonizácii by to naozaj pomohlo. Aby sme to dosiahli, musíme niečo dosiahnuť v zmysle zníženie pKa serínu tak, že chce darovať svoj protón.
histidín sa stáva žiaducim riešením tým, že je aktivátor na serín. Keďže pKa histidínu je približne 6,04 a pKa neutrálneho serínu je približne 15,9, bolo by nepravdepodobné, že by sa to stalo, aj keď …
Avšak, aspartát má pKa približne 3,90 a záporný náboj, takže ako hydrofilná zlúčenina chce byť kyselinou, takže histidín aj aspartát tvoria interakciu H-väzby.
Aspartátová túžba po protónovom histidíne vyvoláva histidín zvýšiť jeho pKa udržať si pravý horný protón, vyvažovanie rozdiel pKa medzi histidínom a serínom, podporujúci deprotonáciu serínu za vzniku interakcie H-väzby.
Ako dodatočný bonus tiež aspartate orientuje histidín tak, aby sa jeho voľne sa otáčajúci metylénový mostík udržal na mieste. Pekný!
Spoločne tieto pôsobia v trypsíne, napríklad na katalyzáciu hydrolýzy / štiepenia špecifických peptidových väzieb iných proteínov.
ČO JE TO MECHANIZMUS?
No, je to tento veľký diagram:
- Histidín ukradne protón zo serínu, aktivuje ho.
- Serín je teraz schopný napadnúť karbonylový uhlík, ktorý sa viaže v tetraedrickom komplexe.
- Komplex je stabilizovaný chrbticou
# "NH" # z blízkeho glycínu, ako aj z rovnakého serínu. Histidín je orientovaný aspartátom. Tetraedrický komplex sa zrúti, aby štiepil peptidovú väzbu a výsledný produkt# "NH" # ukradne protón z histidínu. - Histidín môže zachytiť protón z vody, pretože jeho pKa je stále zvýšená (čím je kyselina slabšia) po stabilizácii aspartátom.
- Hydroxid je veľký nukleofil, ktorý potom môže zaútočiť na karbonylový uhlík na druhý nukleofilný atak.
- Tetraedrický komplex, opäť stabilizovaný chrbticou
# "NH" # na glycíne a tom istom seríne sa potom môže zbaliť, štiepiť serín hneď a uchopiť protón histidínu ako predtým. - Končíme karboxylovou kyselinou, ktorá je výsledkom hydrolýzy peptidovej väzby.
Jack trávi 1 4/5 na svojich domácich úlohách ako Jill. Minulý týždeň Jill strávil 9 3/4 hodiny robiť domáce úlohy. Ako dlho strávil Jack robiť domáce úlohy?
Približne 17,6 hodín. Ak necháme a = počet hodín, ktoré Jack strávil na domácej úlohe a b = počet hodín, ktoré Jill strávila na domácej úlohe, môžeme nastaviť zadanú rovnicu pomocou daných informácií. Vzhľadom k tomu, Jack strávil 1 4/5 krát tak dlho, ako Jill, to je rovnica: a = 1 4/5 * b Aby to trochu jednoduchšie na oči, môžete previesť zmiešané číslo do zlomku. a = 9/5 * b Teraz, keď vieme, že Jill strávila 9 3/4 hodiny na domácom cvičení, jednoducho ho zapojte ako b. a = 9/5 * 9 3/4 Teraz jednod
Prvý zvon zazvoní každých 20 minút, druhý zvon zazvoní každých 30 minút a tretí zvon zazvoní každých 50 minút. Ak budú všetky tri zvony zvoniť v rovnakom čase o 12:00 hod., Kedy budú nabudúce tri zvončeky spolu zazvoniť?
"17:00 pm" Takže najprv zistíte, LCM, alebo najmenej spoločný násobok, (možno nazvať LCD, najmenší spoločný menovateľ). LCM 20, 30 a 50 je v podstate 10 * 2 * 3 * 5, pretože vynásobíte 10, pretože to je spoločný faktor. 10 * 2 * 3 * 5 = 300 Toto je počet minút. Ak chcete zistiť počet hodín, jednoducho rozdelíte na 60 a dostanete 5 hodín. Potom budete počítať ďalších 5 hodín od "12:00 pm" a dostať "17:00".
Kristen kúpila dva spojky, ktoré stoja každý 1,25 dolárov, dve spojky, ktoré stoja každý 4,75 dolárov, dva balíčky papiera, ktoré stoja 1,50 dolárov za balík, štyri modré perá, ktoré stoja za každú cenu 1,15 USD a štyri ceruzky, ktoré stoja za každých 0,35 USD. Koľko utratila?
Strávila 21 dolárov alebo 21,00 dolárov.Najprv chcete zoznam vecí, ktoré kúpila a cena úhľadne: 2 viazače -> $ 1.25xx2 2 viazače -> $ 4.75xx2 2 balíky papiera -> $ 1.50xx2 4 modré perá -> $ 1.15xx4 4 ceruzky -> $ 0.35xx4 Teraz máme reťazec to všetko do rovnice: $ 1.25xx2 + $ 4.75xx2 + $ 1.50xx2 + $ 1.15xx4 + $ 0.35xx4 Vyriešime každú časť (násobenie) $ 1.25xx2 = $ 2.50 $ 4.75xx2 = $ 9.50 $ 1.50xx2 = $ 3.00 $ 1.15xx4 = $ 4.60 $ 0.35xx4 = $ 1.50xx = $ 4.60 $ 0.35xx4 = $ 1.50xx = $ 4.60 $ 0.35xx4 = $ 1.50xx = $ 4.60 $ 0.35xx4 = 1.40 $ $: $ 1.50 +