Než som definovať, čo sú izoméry, dám vám jednoduchý príklad, myslím, že máte tri kruhy, z ktorých každá má rovnakú farbu, rovnaký polomer a rovnakú hmotnosť. Tri kruhy môžete usporiadať tak, že ich umiestnite vedľa seba alebo môžete usporiadať tri prekrývajúce sa. V oboch usporiadaniach majú rovnakú hmotnosť, rovnakú farbu, ale to, čo sa líši, je usporiadanie kruhov. To definuje izoméry.
Izoméry sú molekuly s rovnakým chemickým vzorcom, ale s rôznymi chemickými štruktúrami. To znamená, že izoméry obsahujú rovnaký počet atómov každého prvku, ale majú rozdielne usporiadanie atómov v priestore.
Jednoduchý príklad izomérie je daný propanolom: Má vzorec
dva izoméry majú rovnaký molekulový vzorec, rovnakú hmotnosť, ale líšia sa v usporiadaní hydroxylovej (OH) skupiny.