Aký by mohol byť problém, ak sa kapely neobjavia v programe Western Blot?

Aký by mohol byť problém, ak sa kapely neobjavia v programe Western Blot?
Anonim

odpoveď:

Mnoho …

vysvetlenie:

Existuje mnoho dôvodov, prečo sa kapely nemusia objaviť na western blote. Pracovala vzorka a kombinácie protilátok v minulosti?

Nižšie sú len niektoré, o ktorých si v súčasnosti myslím, že môžu spôsobiť, že sa kapely nezobrazia:

  1. Preniesol proteín z gélu? Skúste zafarbiť membránu niečo ako ponceau S alebo amido black, aby ste zistili, či sú prítomné kapely. Niekedy môžete vidieť proteínové pásy na membráne zmáčaním a držaním v uhle voči svetlu.

  2. Pracuje primárna protilátka? To je ťažké vyskúšať a jediný spôsob, ako môžete je, je zahrnutím pozitívnej kontroly, kde viete, že máte prítomný proteín. Ak máte nejaký proteín, o ktorý máte záujem, môžete ho vyskúšať na membráne Western blotting (t.j. nechcete spustiť gél) a vidieť, či dostanete výsledok, ak spracujete membránu, akoby to bol western blot.

  3. Je sekundárna protilátka rozpoznávajúca primárnu protilátku? Opäť tvrdý test. O jedinom teste, ktorý môžete urobiť, je bodový test uvedený vyššie v bode 2.

  4. Pracuje "detekčný systém"? V závislosti od metódy detekcie, ktorú používate, by ste sa mohli pokúsiť o zvýšenie množstva sekundárnej protilátky, aby sa zistilo, či funguje detekčný roztok, ako aj spúšťacie činidlo / enzým na sekundárnej protilátke. To znamená, že môžete spustiť reakciu len so sekundárnou protilátkou?

Nakoniec by to mohlo byť tak jednoduché, ako jedno z riešení použitých pri snímaní sprisahania, ktoré je nesprávne zostavené. Napríklad, ak je koncentrácia soli v pufri nesprávna, môže to spôsobiť uvoľnenie protilátok z blotu. To isté by sa stalo aj vtedy, ak by pH pufrov bolo nesprávne.

"Najpodivnejšia" príčina pre western blot nefunguje, že som osobne zažil bol, keď sme zmenili dodávateľa sušeného mlieka sme použili na blokovanie membrány. Prášok od nového dodávateľa obsahoval fosfotyrozín fosfatázu, ktorá odstránila všetky fosfátové skupiny, ktoré sme sa snažili detegovať pomocou našej anti-fosfotyrozínovej protilátky.