Prečo sa GAPDH používa v Western Blot? + Príklad

Prečo sa GAPDH používa v Western Blot? + Príklad
Anonim

odpoveď:

GAPDH sa často používa ako kontrola zavádzania.

vysvetlenie:

Pri Western blote často používame GAPDH ako kontrolu zavádzania. To znamená, že sondovaním na GAPDH môžeme overiť, že máme naložené dráhy ekvivalentných množstiev proteínov na rôznych dráhach blotu.

Príklad použitia - povedzme, že máme ochorenie, o ktorom si myslíme, že spôsobuje zvýšenie určitého proteínu v bunke. Vytvorili by sme vzorku zo „zdravých“ buniek a ďalšiu vzorku z „chorých“ buniek. Potom by sme naložili ekvivalentné proteínové množstvá oboch vzoriek na gél pre Western blot.

Po sondovaní blotu pre náš proteín, ktorý je predmetom záujmu, zistíme, že v chorých bunkách je hladina proteínu skutočne zvýšená (to znamená, že na blote je produkovaný tmavší pás). Aby sme dokázali, že tento nárast proteínu je spôsobený zmenou expresie v bunke, namiesto zaťaženia artefaktu (to znamená, že viac inštitútového pásma je spôsobený zmenou expresie proteínu v bunkách, a nie náhodným naložením viac "vzorky", ako je "zdravé", by sme tiež sondovali blot pre GAPDH, aby sme ukázali, že celkové hladiny proteínov sú rovnaké v oboch dráhach.

Tým, že robíme toto, ukazujeme, že ekvivalentný proteín bol naložený v dvoch dráhach a že zmena intenzity pásma, ktorú pozorujeme, je spôsobená zmenami v expresii proteínu pre proteín záujmu.